从隋朝开始，历代太医院都有祝由术
华夏文明，上下五千年。祝由医学，源远流长。起自三代，盛行秦汉，立科隋唐，集成宋元，于明清则日趋式微。在历史的长河中，“祝由术”呈现过辉煌，也经历了低谷，但不可否认的是，祝由之术，与其他传统医学疗法一样，为中华民族的繁衍昌盛和炎黄子孙的健康做出了不可磨灭的贡献。
祝由术，作为一种独特的中医疗法，渊源悠久。《黄帝内经·移精变气论》指出：“古之治病，惟其移精变气，可祝由而已。”
一、隋代以前传说颇多
在隋代以前，祝由术虽然并未未纳入官方认可的正式医学体系，但在史料中有着很多记录。
几个传说。
上古时期的苗父。据汉代刘向《说苑·辨物篇》记载：“上古之为医者曰苗父。苗父之为医也，以营为席，以刍为狗，北面而祝，发十言耳。诸扶而来者，舆而来者，皆平复如故。”这里描绘了原始祝由术的具体操作方法。
东汉时期的徐登、赵炳。据《后汉书·徐登传》描述二人“共以其术疗病，各相谓曰：今既同志，且可各试所能。登乃禁溪水，水为不流；炳复次禁枯树，树即生荑。二人相视而笑，共行其道焉”。赵炳的祝由术可以使枯树生芽复活。
二、自隋代开始得到官方的承认
隋代：
《隋书·百官志·卷二十八》记载，太医署设有”祝禁博士二人”。
唐代 ：
《唐六典·卷十四·太医署》载：“医博士一人，医助教一人，医师二十人，医工一百人，医生四十人，典学二人；针博士一人，针助教一人，针师十人，针工三十人，针生二十人；按摩博士一人，按摩师四人，按摩工十六人，按摩生十五人；咒禁博士一人，咒禁师二人，咒禁医八人，咒禁生十人”。其中，“咒禁博士一人，从九品下，咒禁博士掌教咒禁生以咒禁祓除邪魅之为厉者”。由此官方设置可见，唐代太医署的咒禁（祝由）科，其设置已然比较完备，且职责明确，教学内容丰富，并与医科、针科、按摩科并列为医学四科。
宋代：
《宋史·职官志》载：“太医局有丞，有教授，有九科医生，额三百人”。《元丰备对》补充道：“太医局九科学生额三百人：大方脉一百二十人，风科八十人，小方脉二十人，眼科二十人，疮肿兼折疡二十人，产科十人，口齿兼咽喉科十人，针兼灸科十人，金镞兼书噤（书噤即为祝由疗法）科十人”。
元代：
医学被分为十三科。《元史·卷八十一·选举志·学校》记载，各科分别为：大方脉科、小方脉科、风科、杂科、产科、眼科、口齿科、咽喉科、正骨科、金疮肿科、针灸科、祝由科以及禁科。至此，祝由科被正式命名。且禁科亦可归于广义的祝由科之中。
明代：
明代沿用元代旧制，医学亦分为十三科。《明史·卷七十四·志第五十·职官三》载：“太医院掌医疗之法。凡医术十三科，医官、医生、医士，专科肄业：曰大方脉、曰小方脉、曰妇人、曰疮疡、曰针灸、曰眼、曰口齿、曰接骨、曰伤寒、曰咽喉、曰金镞、曰按摩、曰祝由”。
清代：
清代太医院因为按摩和祝由科失传，将十三科减为十一科，由此祝由科在国家医事制度和医学教育体系中被删除，至此祝由彻底沦落民间。明末著名医家张介宾之著作《类经》亦可为佐证。《类经·卷十二·论治类·祝由》言：“按国朝医术十三科：曰大方脉、曰小方脉、曰妇人、曰疮疡、曰针灸、曰眼、曰口齿、曰接骨、曰伤寒、曰咽喉、曰金镞、曰按摩、曰祝由。今按摩、祝由二科失其传，惟民间尚有之”。
三、传承往圣绝学，勿忘初心
总之，由历代医籍、医制来看，祝由之术，源远流长，起自三代，盛行秦汉，立科隋唐，集成宋元式微于明清。在隋代到明末的这跨域千年的漫长时期里，祝由术一直作为官方认可的正式医学手段在发挥着独有的作用，其效果肯定、确切，乃济世救人之善法。愿所有有幸学习了祝由正法的人，于治学济世之路上，临渊履冰，勿忘初心，令“功效出于意表”的祝由之法，获得良好的继承和发展。
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